Trong những năm gần đây, cải cách hành chính đang được ngành Y tế Hà Nội xác định là một trong những nhiệm vụ trọng tâm nhằm nâng cao hiệu quả quản lý và chất lượng phục vụ người dân. Việc đơn giản hóa thủ tục, ứng dụng công nghệ thông tin và nâng cao trách nhiệm của đội ngũ cán bộ, viên chức đang từng bước mang lại những thay đổi tích cực trong hoạt động của ngành.